MACCS | Pubchem | CDK standard | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AUC | BAC | SEN | SPEC | AUC | BAC | SEN | SPEC | AUC | BAC | SEN | SPEC | |
SVM | 0.87 | 0.81 | 0.82 | 0.79 | 0.88 | 0.82 | 0.84 | 0.80 | 0.87 | 0.81 | 0.84 | 0.78 |
RF | 0.88 | 0.82 | 0.86 | 0.77 | 0.88 | 0.81 | 0.86 | 0.76 | 0.88 | 0.81 | 0.83 | 0.79 |
DT | 0.81 | 0.77 | 0.80 | 0.74 | 0.79 | 0.76 | 0.78 | 0.74 | 0.80 | 0.75 | 0.79 | 0.72 |
kNN | 0.84 | 0.76 | 0.84 | 0.68 | 0.84 | 0.77 | 0.81 | 0.73 | 0.83 | 0.75 | 0.81 | 0.70 |
CDK Extended | Atom centered | |||||||||||
AUC | BAC | SEN | SPEC | AUC | BAC | SEN | SPEC | |||||
SVM | 0.87 | 0.81 | 0.83 | 0.79 | 0.88 | 0.82 | 0.84 | 0.80 | ||||
RF | 0.87 | 0.80 | 0.82 | 0.78 | 0.88 | 0.81 | 0.82 | 0.80 | ||||
DT | 0.78 | 0.75 | 0.80 | 0.71 | 0.79 | 0.75 | 0.79 | 0.71 | ||||
kNN | 0.84 | 0.77 | 0.81 | 0.73 | 0.84 | 0.77 | 0.82 | 0.72 |