TY - JOUR AU - Hornberg, J. J. AU - Laursen, M. AU - Brenden, N. AU - Persson, M. AU - Thougaard, A. V. AU - Toft, D. B. AU - Mow, T. PY - 2014 DA - 2014// TI - Exploratory toxicology as an integrated part of drug discovery. Part i: why and how JO - Drug Discov Today VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/j.drudis.2013.12.008 DO - 10.1016/j.drudis.2013.12.008 ID - Hornberg2014 ER - TY - JOUR AU - Giacomini, K. M. AU - Krauss, R. M. AU - Roden, D. M. AU - Eichelbaum, M. AU - Hayden, M. R. AU - Nakamura, Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - When good drugs go bad JO - Nature VL - 446 UR - https://doi.org/10.1038/446975a DO - 10.1038/446975a ID - Giacomini2007 ER - TY - JOUR AU - Liang, X. AU - Zhang, P. AU - Yan, L. AU - Fu, Y. AU - Peng, F. AU - Qu, L. AU - Shao, M. AU - Chen, Y. AU - Chen, Z. PY - 2017 DA - 2017// TI - LRSSL: predict and interpret drug-disease associations based on data integration using sparse subspace learning JO - Bioinformatics (Oxford, England) VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw770 DO - 10.1093/bioinformatics/btw770 ID - Liang2017 ER - TY - JOUR AU - Luo, H. AU - Wang, J. AU - Li, M. AU - Luo, J. AU - Peng, X. AU - Wu, F. -. X. AU - Pan, Y. PY - 2016 DA - 2016// TI - Drug repositioning based on comprehensive similarity measures and bi-random walk algorithm JO - Bioinformatics (Oxford, England) VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw228 DO - 10.1093/bioinformatics/btw228 ID - Luo2016 ER - TY - JOUR AU - Luo, H. AU - Li, M. AU - Wang, S. AU - Liu, Q. AU - Li, Y. AU - Wang, J. PY - 2018 DA - 2018// TI - Computational drug repositioning using low-rank matrix approximation and randomized algorithms JO - Bioinformatics (Oxford, England) VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty013 DO - 10.1093/bioinformatics/bty013 ID - Luo2018 ER - TY - JOUR AU - Modi, S. AU - Hughes, M. AU - Garrow, A. AU - White, A. PY - 2012 DA - 2012// TI - The value of in silico chemistry in the safety assessment of chemicals in the consumer goods and pharmaceutical industries JO - Drug Discov Today VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.drudis.2011.10.022 DO - 10.1016/j.drudis.2011.10.022 ID - Modi2012 ER - TY - JOUR AU - Ivanov, S. M. AU - Lagunin, A. A. AU - Poroikov, V. V. PY - 2016 DA - 2016// TI - In silico assessment of adverse drug reactions and associated mechanisms JO - Drug Discov Today VL - 21 UR - https://doi.org/10.1016/j.drudis.2015.07.018 DO - 10.1016/j.drudis.2015.07.018 ID - Ivanov2016 ER - TY - JOUR AU - Yang, H. AU - Sun, L. AU - Li, W. AU - Liu, G. AU - Tang, Y. PY - 2018 DA - 2018// TI - Prediction of chemical toxicity for drug design using machine learning methods and structural alerts JO - Front Chem VL - 6 UR - https://doi.org/10.3389/fchem.2018.00030 DO - 10.3389/fchem.2018.00030 ID - Yang2018 ER - TY - JOUR AU - Xu, Y. AU - Dai, Z. AU - Chen, F. AU - Gao, S. AU - Pei, J. AU - Lai, L. PY - 2015 DA - 2015// TI - Deep learning for drug-induced liver injury JO - J Chem Inf Model VL - 55 UR - https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5b00238 DO - 10.1021/acs.jcim.5b00238 ID - Xu2015 ER - TY - JOUR AU - Atias, N. AU - Sharan, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - An algorithmic framework for predicting side effects of drugs JO - J Comput Biol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1089/cmb.2010.0255 DO - 10.1089/cmb.2010.0255 ID - Atias2011 ER - TY - JOUR AU - Mizutani, S. AU - Pauwels, E. AU - Stoven, V. AU - Goto, S. AU - Yamanishi, Y. PY - 2012 DA - 2012// TI - Relating drug-protein interaction network with drug side effects JO - Bioinformatics (Oxford, England) VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts383 DO - 10.1093/bioinformatics/bts383 ID - Mizutani2012 ER - TY - STD TI - Fukuzaki M, Seki M, Kashima H, Sese, J (2009) Side effect prediction using cooperative pathways. In: Proceedings of IEEE international conference on bioinformatics and biomedicine, pp. 142–147. https://doi.org/10.1109/BIBM.2009.26 ID - ref12 ER - TY - JOUR AU - Lee, S. AU - Lee, K. H. AU - Song, M. AU - Lee, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Building the process-drug-side effect network to discover the relationship between biological processes and side effects JO - BMC Bioinf VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-S2-S2 DO - 10.1186/1471-2105-12-S2-S2 ID - Lee2011 ER - TY - JOUR AU - Yamanishi, Y. AU - Pauwels, E. AU - Kotera, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Drug side-effect prediction based on the integration of chemical and biological spaces JO - J Chem Inf Model VL - 52 UR - https://doi.org/10.1021/ci2005548 DO - 10.1021/ci2005548 ID - Yamanishi2012 ER - TY - JOUR AU - Wang, Z. AU - Clark, N. R. AU - Ma’ayan, A. PY - 2016 DA - 2016// TI - Drug-induced adverse events prediction with the lincs 1000 data JO - Bioinformatics (Oxford, England) VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw168 DO - 10.1093/bioinformatics/btw168 ID - Wang2016 ER - TY - JOUR AU - Liu, M. AU - Wu, Y. AU - Chen, Y. AU - Sun, J. AU - Zhao, Z. AU - Chen, X. -. W. AU - Matheny, M. E. AU - Xu, H. PY - 2012 DA - 2012// TI - Large-scale prediction of adverse drug reactions using chemical, biological, and phenotypic properties of drugs JO - JAMIA VL - 19 UR - https://doi.org/10.1136/amiajnl-2011-000699 DO - 10.1136/amiajnl-2011-000699 ID - Liu2012 ER - TY - JOUR AU - Cao, D. -. S. AU - Xiao, N. AU - Li, Y. -. J. AU - Zeng, W. -. B. AU - Liang, Y. -. Z. AU - Lu, A. -. P. AU - Xu, Q. -. S. AU - Chen, A. F. PY - 2015 DA - 2015// TI - Integrating multiple evidence sources to predict adverse drug reactions based on a systems pharmacology model JO - CPT Pharm Syst Pharmacol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1002/psp4.12002 DO - 10.1002/psp4.12002 ID - Cao2015 ER - TY - JOUR AU - Pauwels, E. AU - Stoven, V. AU - Yamanishi, Y. PY - 2011 DA - 2011// TI - Predicting drug side-effect profiles: a chemical fragment-based approach JO - BMC Bioinf VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-169 DO - 10.1186/1471-2105-12-169 ID - Pauwels2011 ER - TY - STD TI - Xiao C, Zhang P, Chaowalitwongse WA, Hu J, Wang F (2017) Adverse drug reaction prediction with symbolic latent dirichlet allocation. In: Proceedings of the thirty-first AAAI conference on artificial intelligence ID - ref19 ER - TY - JOUR AU - Kuhn, M. AU - Al Banchaabouchi, M. AU - Campillos, M. AU - Jensen, L. J. AU - Gross, C. AU - Gavin, A. -. C. AU - Bork, P. PY - 2013 DA - 2013// TI - Systematic identification of proteins that elicit drug side effects JO - Mol Syst Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/msb.2013.10 DO - 10.1038/msb.2013.10 ID - Kuhn2013 ER - TY - JOUR AU - Iwata, H. AU - Mizutani, S. AU - Tabei, Y. AU - Kotera, M. AU - Goto, S. AU - Yamanishi, Y. PY - 2013 DA - 2013// TI - Inferring protein domains associated with drug side effects based on drug-target interaction network JO - BMC Syst Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1752-0509-7-S6-S18 DO - 10.1186/1752-0509-7-S6-S18 ID - Iwata2013 ER - TY - JOUR AU - Chen, X. AU - Shi, H. AU - Yang, F. AU - Yang, L. AU - Lv, Y. AU - Wang, S. AU - Dai, E. AU - Sun, D. AU - Jiang, W. PY - 2016 DA - 2016// TI - Large-scale identification of adverse drug reaction-related proteins through a random walk model JO - Sci Rep VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/srep36325 DO - 10.1038/srep36325 ID - Chen2016 ER - TY - STD TI - Xu C, Tao D, Xu C (2013) A survey on multi-view learning. arXiv:1304.5634v1 UR - http://arxiv.org/abs/1304.5634v1 ID - ref23 ER - TY - JOUR AU - Zhang, X. AU - Li, L. AU - Ng, M. K. AU - Zhang, S. PY - 2017 DA - 2017// TI - Drug-target interaction prediction by integrating multiview network data JO - Comput Biol Chem VL - 69 UR - https://doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2017.03.011 DO - 10.1016/j.compbiolchem.2017.03.011 ID - Zhang2017 ER - TY - JOUR AU - Zhang, M. AU - Zhou, Z. PY - 2014 DA - 2014// TI - A review on multi-label learning algorithms JO - IEEE Transac Knowl Data Eng VL - 26 UR - https://doi.org/10.1109/TKDE.2013.39 DO - 10.1109/TKDE.2013.39 ID - Zhang2014 ER - TY - JOUR AU - Cerri, R. AU - Barros, R. C. AU - de Carvalho, A. C. AU - Jin, Y. PY - 2016 DA - 2016// TI - Reduction strategies for hierarchical multi-label classification in protein function prediction JO - BMC Bioinf VL - 17 UR - https://doi.org/10.1186/s12859-016-1232-1 DO - 10.1186/s12859-016-1232-1 ID - Cerri2016 ER - TY - JOUR AU - Wan, S. AU - Mak, M. -. W. AU - Kung, S. -. Y. PY - 2016 DA - 2016// TI - Sparse regressions for predicting and interpreting subcellular localization of multi-label proteins JO - BMC Bioinf VL - 17 UR - https://doi.org/10.1186/s12859-016-0940-x DO - 10.1186/s12859-016-0940-x ID - Wan2016 ER - TY - JOUR AU - Zhang, M. -. L. AU - Wu, L. PY - 2015 DA - 2015// TI - Lift: Multi-label learning with label-specific features JO - IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell VL - 37 UR - https://doi.org/10.1109/TPAMI.2014.2339815 DO - 10.1109/TPAMI.2014.2339815 ID - Zhang2015 ER - TY - JOUR AU - Belkin, M. AU - Niyogi, P. AU - Sindhwani, V. PY - 2006 DA - 2006// TI - Manifold regularization: a geometric framework for learning from labeled and unlabeled examples JO - J. Mach. Learn. Res. VL - 7 ID - Belkin2006 ER - TY - JOUR AU - Belkin, M. AU - Niyogi, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Laplacian eigenmaps and spectral techniques for embedding and clustering JO - Adv Neu Inf Process Syst VL - 14 ID - Belkin2001 ER - TY - JOUR AU - Xia, T. AU - Tao, D. AU - Mei, T. AU - Zhang, Y. PY - 2010 DA - 2010// TI - Multiview spectral embedding. IEEE transactions on systems, man, and cybernetics. Part B, cybernetics JO - IEEE Syst Man Cyber Soc VL - 40 UR - https://doi.org/10.1109/TSMCB.2009.2039566 DO - 10.1109/TSMCB.2009.2039566 ID - Xia2010 ER - TY - JOUR AU - Shi, C. AU - Ruan, Q. AU - An, G. AU - Ge, C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Semi-supervised sparse feature selection based on multi-view laplacian regularization JO - Image Vision Comput VL - 41 UR - https://doi.org/10.1016/j.imavis.2015.06.006 DO - 10.1016/j.imavis.2015.06.006 ID - Shi2015 ER - TY - CHAP AU - Mojoo, J. AU - Kurosawa, K. AU - Kurita, T. ED - Karray, F. ED - Campilho, A. ED - Cheriet, F. PY - 2017 DA - 2017// TI - Deep CNN with graph laplacian regularization for multi-label image annotation BT - Image analysis and recognition PB - Springer CY - Cham UR - https://doi.org/10.1007/978-3-319-59876-5_3 DO - 10.1007/978-3-319-59876-5_3 ID - Mojoo2017 ER - TY - JOUR AU - Li, C. AU - Li, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Network-constrained regularization and variable selection for analysis of genomic data JO - Bioinformatics (Oxford, England) VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn081 DO - 10.1093/bioinformatics/btn081 ID - Li2008 ER - TY - JOUR AU - Kuhn, M. AU - Letunic, I. AU - Jensen, L. J. AU - Bork, P. PY - 2016 DA - 2016// TI - The sider database of drugs and side effects JO - Nucleic Acids Res VL - 44 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkv1075 DO - 10.1093/nar/gkv1075 ID - Kuhn2016 ER - TY - JOUR AU - Wang, Y. AU - Xiao, J. AU - Suzek, T. O. AU - Zhang, J. AU - Wang, J. AU - Bryant, S. H. PY - 2009 DA - 2009// TI - Pubchem: a public information system for analyzing bioactivities of small molecules JO - Nucleic Acids Res VL - 37 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkp456 DO - 10.1093/nar/gkp456 ID - Wang2009 ER - TY - JOUR AU - Law, V. AU - Knox, C. AU - Djoumbou, Y. AU - Jewison, T. AU - Guo, A. C. AU - Liu, Y. AU - Maciejewski, A. AU - Arndt, D. AU - Wilson, M. AU - Neveu, V. AU - Tang, A. AU - Gabriel, G. AU - Ly, C. AU - Adamjee, S. AU - Dame, Z. T. AU - Han, B. AU - Zhou, Y. AU - Wishart, D. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Drugbank 4.0: shedding new light on drug metabolism JO - Nucleic Acids Res VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt1068 DO - 10.1093/nar/gkt1068 ID - Law2014 ER - TY - JOUR AU - Mitchell, A. AU - Chang, H. -. Y. AU - Daugherty, L. AU - Fraser, M. AU - Hunter, S. AU - Lopez, R. AU - McAnulla, C. AU - McMenamin, C. AU - Nuka, G. AU - Pesseat, S. AU - Sangrador-Vegas, A. AU - Scheremetjew, M. AU - Rato, C. AU - Yong, S. -. Y. AU - Bateman, A. AU - Punta, M. AU - Attwood, T. K. AU - Sigrist, C. J. A. AU - Redaschi, N. AU - Rivoire, C. AU - Xenarios, I. AU - Kahn, D. AU - Guyot, D. AU - Bork, P. AU - Letunic, I. AU - Gough, J. AU - Oates, M. AU - Haft, D. AU - Huang, H. AU - Natale, D. A. AU - Wu, C. H. AU - Orengo, C. AU - Sillitoe, I. AU - Mi, H. AU - Thomas, P. D. AU - Finn, R. D. PY - 2015 DA - 2015// TI - The interpro protein families database: the classification resource after 15 years JO - Nucleic Acids Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gku1243 DO - 10.1093/nar/gku1243 ID - Mitchell2015 ER - TY - JOUR AU - Consortium, U. PY - 2010 DA - 2010// TI - The universal protein resource (uniprot) in 2010 JO - Nucleic Acids Res VL - 38 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkp846 DO - 10.1093/nar/gkp846 ID - Consortium2010 ER - TY - JOUR AU - Koleti, A. AU - Terryn, R. AU - Stathias, V. AU - Chung, C. AU - Cooper, D. J. AU - Turner, J. P. AU - Vidovic, D. AU - Forlin, M. AU - Kelley, T. T. AU - D’Urso, A. AU - Allen, B. K. AU - Torre, D. AU - Jagodnik, K. M. AU - Wang, L. AU - Jenkins, S. L. AU - Mader, C. AU - Niu, W. AU - Fazel, M. AU - Mahi, N. AU - Pilarczyk, M. AU - Clark, N. AU - Shamsaei, B. AU - Meller, J. AU - Vasiliauskas, J. AU - Reichard, J. AU - Medvedovic, M. AU - Ma’ayan, A. AU - Pillai, A. AU - Schürer, S. C. PY - 2018 DA - 2018// TI - Data portal for the library of integrated network-based cellular signatures (lincs) program: integrated access to diverse large-scale cellular perturbation response data JO - Nucleic Acids Res VL - 46 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkx1063 DO - 10.1093/nar/gkx1063 ID - Koleti2018 ER - TY - JOUR AU - Dong, J. AU - Yao, Z. -. J. AU - Zhang, L. AU - Luo, F. AU - Lin, Q. AU - Lu, A. -. P. AU - Chen, A. F. AU - Cao, D. -. S. PY - 2018 DA - 2018// TI - Pybiomed: a python library for various molecular representations of chemicals, proteins and dnas and their interactions JO - J Cheminf VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/s13321-018-0270-2 DO - 10.1186/s13321-018-0270-2 ID - Dong2018 ER - TY - STD TI - Zhu X, Lafferty J, Rosenfeld R (2005) Semi-supervised learning with graphs. Ph.D. thesis, Carnegie Mellon University, language technologies institute, school of computer science Pittsburgh ID - ref42 ER - TY - JOUR AU - Yu, J. AU - Wang, M. AU - Tao, D. PY - 2012 DA - 2012// TI - Semisupervised multiview distance metric learning for cartoon synthesis JO - IEEE Transac Image Process VL - 21 UR - https://doi.org/10.1109/TIP.2012.2207395 DO - 10.1109/TIP.2012.2207395 ID - Yu2012 ER - TY - JOUR AU - Nie, F. AU - Xu, D. AU - Tsang, I. W. AU - Zhang, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Flexible manifold embedding: a framework for semi-supervised and unsupervised dimension reduction JO - IEEE Transac Image Process VL - 19 UR - https://doi.org/10.1109/TIP.2010.2044958 DO - 10.1109/TIP.2010.2044958 ID - Nie2010 ER - TY - JOUR AU - Ding, C. AU - Li, T. AU - Jordan, M. I. PY - 2010 DA - 2010// TI - Convex and semi-nonnegative matrix factorizations JO - IEEE Transac Pattern Anal Mach Intell VL - 32 UR - https://doi.org/10.1109/TPAMI.2008.277 DO - 10.1109/TPAMI.2008.277 ID - Ding2010 ER - TY - JOUR AU - Nesterov, Y. PY - 1983 DA - 1983// TI - A method of solving a convex programming problem with convergence rate $$o(1/k^2)$$o(1/k2) JO - Soviet Math Doklady VL - 27 ID - Nesterov1983 ER - TY - JOUR AU - Pedregosa, F. AU - Varoquaux, G. AU - Gramfort, A. AU - Michel, V. AU - Thirion, B. AU - Grisel, O. AU - Blondel, M. AU - Prettenhofer, P. AU - Weiss, R. AU - Dubourg, V. AU - Vanderplas, J. AU - Passos, A. AU - Cournapeau, D. AU - Brucher, M. AU - Perrot, M. AU - Duchesnay, E. PY - 2011 DA - 2011// TI - Scikit-learn: machine learning in python JO - J Mach Learn Res VL - 12 ID - Pedregosa2011 ER - TY - JOUR AU - Fan, R. -. E. AU - Chang, K. -. W. AU - Hsieh, C. -. J. AU - Wang, X. -. R. AU - Lin, C. -. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Liblinear: a library for large linear classification JO - J Mach Learn Res VL - 9 ID - Fan2008 ER - TY - STD TI - Witten D, Tibshirani R, Gross S, Narasimhan B (2018) PMA: Penalized multivariate analysis. R package version 1.0.11. https://CRAN.R-project.org/package=PMA UR - https://CRAN.R-project.org/package=PMA ID - ref49 ER - TY - JOUR AU - Zou, H. AU - Hastie, T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Regularization and variable selection via the elastic net JO - J R Stat Soc VL - 67 UR - https://doi.org/10.1111/j.1467-9868.2005.00503.x DO - 10.1111/j.1467-9868.2005.00503.x ID - Zou2005 ER - TY - JOUR AU - Davis, A. P. AU - Grondin, C. J. AU - Johnson, R. J. AU - Sciaky, D. AU - King, B. L. AU - McMorran, R. AU - Wiegers, J. AU - Wiegers, T. C. AU - Mattingly, C. J. PY - 2017 DA - 2017// TI - The comparative toxicogenomics database: update 2017 JO - Nucleic Acids Res VL - 45 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkw838 DO - 10.1093/nar/gkw838 ID - Davis2017 ER - TY - JOUR AU - Bonvin, A. AU - Mesnil, A. AU - Nicolini, F. E. AU - Cotte, L. AU - Michallet, M. AU - Descotes, J. AU - Vial, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Dasatinib-induced acute hepatitis JO - Leuk Lymph VL - 49 UR - https://doi.org/10.1080/10428190802136384 DO - 10.1080/10428190802136384 ID - Bonvin2008 ER - TY - JOUR AU - Takeda, M. AU - Okamoto, I. AU - Nakagawa, K. PY - 2015 DA - 2015// TI - Clinical development of nintedanib for advanced non-small-cell lung cancer JO - Therap Clin Risk Manag VL - 11 UR - https://doi.org/10.2147/TCRM.S76646 DO - 10.2147/TCRM.S76646 ID - Takeda2015 ER - TY - JOUR AU - Shah, R. R. AU - Morganroth, J. AU - Shah, D. R. PY - 2013 DA - 2013// TI - Hepatotoxicity of tyrosine kinase inhibitors: clinical and regulatory perspectives JO - Drug Saf VL - 36 UR - https://doi.org/10.1007/s40264-013-0048-4 DO - 10.1007/s40264-013-0048-4 ID - Shah2013 ER - TY - JOUR AU - Jaeschke, H. AU - Duan, L. AU - Akakpo, J. Y. AU - Farhood, A. AU - Ramachandran, A. PY - 2018 DA - 2018// TI - The role of apoptosis in acetaminophen hepatotoxicity JO - Food Chem Toxicol VL - 118 UR - https://doi.org/10.1016/j.fct.2018.06.025 DO - 10.1016/j.fct.2018.06.025 ID - Jaeschke2018 ER - TY - JOUR AU - Wang, Q. AU - Wei, L. -. W. AU - Xiao, H. -. Q. AU - Xue, Y. AU - Du, S. -. H. AU - Liu, Y. -. G. AU - Xie, X. -. L. PY - 2017 DA - 2017// TI - Methamphetamine induces hepatotoxicity via inhibiting cell division, arresting cell cycle and activating apoptosis: in vivo and in vitro studies JO - Food Chem Toxicol VL - 105 UR - https://doi.org/10.1016/j.fct.2017.03.030 DO - 10.1016/j.fct.2017.03.030 ID - Wang2017 ER - TY - JOUR AU - Wang, X. AU - Tang, X. AU - Gong, X. AU - Albanis, E. AU - Friedman, S. L. AU - Mao, Z. PY - 2004 DA - 2004// TI - Regulation of hepatic stellate cell activation and growth by transcription factor myocyte enhancer factor 2 JO - Gastroenterology VL - 127 UR - https://doi.org/10.1053/j.gastro.2004.07.007 DO - 10.1053/j.gastro.2004.07.007 ID - Wang2004 ER - TY - JOUR AU - McArthur, K. AU - D’Cruz, A. A. AU - Segal, D. AU - Lackovic, K. AU - Wilks, A. F. AU - O’Donnell, J. A. AU - Nowell, C. J. AU - Gerlic, M. AU - Huang, D. C. S. AU - Burns, C. J. AU - Croker, B. A. PY - 2017 DA - 2017// TI - Defining a therapeutic window for kinase inhibitors in leukemia to avoid neutropenia JO - Oncotarget VL - 8 UR - https://doi.org/10.18632/oncotarget.19678 DO - 10.18632/oncotarget.19678 ID - McArthur2017 ER - TY - JOUR AU - Coulthard, M. G. AU - Morgan, M. AU - Woodruff, T. M. AU - Arumugam, T. V. AU - Taylor, S. M. AU - Carpenter, T. C. AU - Lackmann, M. AU - Boyd, A. W. PY - 2012 DA - 2012// TI - Eph/ephrin signaling in injury and inflammation JO - Am J Pathol VL - 181 UR - https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2012.06.043 DO - 10.1016/j.ajpath.2012.06.043 ID - Coulthard2012 ER - TY - JOUR AU - Becker, G. AU - Blum, H. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Novel opioid antagonists for opioid-induced bowel dysfunction and postoperative ileus JO - Lancet (London, England) VL - 373 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(09)60139-2 DO - 10.1016/S0140-6736(09)60139-2 ID - Becker2009 ER - TY - JOUR AU - Roubille, F. AU - Combes, S. AU - Leal-Sanchez, J. AU - Barrère, C. AU - Cransac, F. AU - Sportouch-Dukhan, C. AU - Gahide, G. AU - Serre, I. AU - Kupfer, E. AU - Richard, S. AU - Hueber, A. -. O. AU - Nargeot, J. AU - Piot, C. AU - BarrèLemaire, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Myocardial expression of a dominant-negative form of daxx decreases infarct size and attenuates apoptosis in an in vivo mouse model of ischemia/reperfusion injury JO - Circulation VL - 116 UR - https://doi.org/10.1161/CIRCULATIONAHA.107.694844 DO - 10.1161/CIRCULATIONAHA.107.694844 ID - Roubille2007 ER - TY - JOUR AU - Xiong, C. AU - Zang, X. AU - Zhou, X. AU - Liu, L. AU - Masucci, M. V. AU - Tang, J. AU - Li, X. AU - Liu, N. AU - Bayliss, G. AU - Zhao, T. C. AU - Zhuang, S. PY - 2017 DA - 2017// TI - Pharmacological inhibition of src kinase protects against acute kidney injury in a murine model of renal ischemia/reperfusion JO - Oncotarget VL - 8 UR - https://doi.org/10.18632/oncotarget.16114 DO - 10.18632/oncotarget.16114 ID - Xiong2017 ER - TY - JOUR AU - Trevor, B. E. AU - Hastie, T. AU - Johnstone, L. AU - Tibshirani, R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Least angle regression JO - Ann Stat VL - 32 ID - Trevor2002 ER - TY - BOOK AU - Reid, S. AU - Grudic, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Regularized linear models in stacked generalization PB - Springer CY - Berlin ID - Reid2009 ER - TY - JOUR AU - Barsky, A. J. AU - Saintfort, R. AU - Rogers, M. P. AU - Borus, J. F. PY - 2002 DA - 2002// TI - Nonspecific medication side effects and the nocebo phenomenon JO - JAMA VL - 287 UR - https://doi.org/10.1001/jama.287.5.622 DO - 10.1001/jama.287.5.622 ID - Barsky2002 ER - TY - BOOK AU - Li, X. -. l. AU - Yu, P. S. AU - Liu, B. AU - Ng, S. K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Positive unlabeled learning for data stream classification PB - SDM, SIAM CY - San Diego UR - https://doi.org/10.1137/1.9781611972795.23 DO - 10.1137/1.9781611972795.23 ID - Li2009 ER - TY - JOUR AU - Langfelder, P. AU - Zhang, B. AU - Horvath, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Defining clusters from a hierarchical cluster tree: the dynamic tree cut package for R JO - Bioinformatics VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm563 DO - 10.1093/bioinformatics/btm563 ID - Langfelder2007 ER -